Data Hantering & LIMS integration

Introduktion
Databashantering och utbyte av data mellan olika databaser och är nyckelområden inom automationsområdet. Det är mycket enkelt att generera stora mängder data, men det är svårare att lagra och utföra operationer på datan så den blir tillgänglig i en annan skepnad och lagra den på en annan plats..

Det finns många olika steg, inte alla används på alla system. Jag beskriver några nedan.

• Ta emot instruktioner för hur prov skall prepareras/analyseras från en extern källa.
• Ta emot data från ett annat automatiserat system eller instrument, datautbyte och handskakningsignaler mellan systemen måste planeras och kontrolleras noga.
• Arkivering av "run-time" data.
• Utföra manipulation/reduktion av data så att det går att skapa vettiga rapporter som är lättilgängliga för slutanvändaren
• Raportera/exportera färdigt analys resultat till externa system

Ofta är datan från en analysmetod bestämd av analysinstrumentets mjukvara, den genererade datamängden är oftast onödigt stor som man inte behöver nedströms i informationskedjan. Våran mjukvara låter användaren sortera indata och välja ut den data som man vill ha kvar och skriver detta till en reducerad datafil i önskat format redo för integration/utbyte mot nästa dataplattform..

Databaser

Den externa källan av data kan vara t.ex. en databastabell eller en enkel textfil. Våran programvara plockar ut den data vi är intresserad av. För indata i systemet kan vår programvara ta emot textfiler eller öppna och läsa en databastabell eller på annat sätt fånga datan vi är intresserad av. Det är enkelt att utbyta data med hjälp mcrosoft ODBC standarden och skicka SQL frågor mot t.ex. Oracle, SQL server och självklart MS Access

En textfil är en ASCII fil i öppet eller binär form. Datan är oftas av typen fast fältlängd fast fältpositione ller att datan är komma separerad eller av CSV typ

aa111111,28,63
aa111112,45,91
..... , ..... , .....
..... , ..... , .....
<sample name>,<data point 1>,<data point 2>

Våran mjukvara passar i Ert system inte tvärtom.